尽管利用PEPc基因调控油料作物油分/蛋白比例获得了成功，然而PEPc基因调控籽粒中油分/蛋白含量的分子机理还不是很明确。本研究欲借助于RNAi技术，特异沉默模式植物拟南芥中PEPcase酶活性，分析转基因拟南芥后代的性状变化。通过拟南芥中PEPc基因来探讨该基因家族可能的分子调控机理。
转基因拟南芥T2代种子，不同盐浓度的1/2MS培养基自行配制，升汞和70%乙醇，以及其他一些玻璃仪器等。
各种试剂及仪器灭菌后，无菌台上操作
（1）种子表面消毒：70%乙醇浸泡30秒；2%升汞浸泡2分钟；无菌水漂洗5次；
（2）用0.1%琼脂悬浮，移液器移至不同浓度的1/2MS固体培养基；
（3）将种子在1/2MS固体培养基上平铺；
（4）培养基在无菌台上吹干，确保培养基表面没有流动的液体；
（5）用封口膜密封培养基，放置在光照良好的温室中。
经过除草剂和PCR筛选鉴定的拟南芥转基因株系，单株收种，记为T1代，T1代种子于0.1％Agrose 水溶胶中置于4℃冰箱，春化24 小时，均匀播种到营养液浸润好的土壤中，待发芽3～5天后，用除草剂（1：3000Bar释稀液）喷洒筛选（除草剂以雾状自然降落均匀分布到叶面上），隔天喷一次，共进行3次，没有黄化死掉的苗为除草剂抗性苗，统计活的抗性植株与黄化死掉的植株，算得遗传分离比。
（1）制胶时不要忘了放底板；倒胶时不应太冷倒入，防止凝固，制胶不平，也不应太热倒入，防止胶板变形；电泳胶的厚度一般为5mm左右，回收胶可相应厚点；
（2）使用离心机时，离心的物品应保持对称（平衡）；在离心任何溶液时，应先检查是否已经在离心管上标注溶液名称加以区别；
（3）使用移液器时应慢吸快打，用好后调至最大刻度放回原处；移液时，应做到细心果断，切误犹豫不决造成试剂浪费；
（4）PCR系统配制时，按顺序加入各种成分，低温保藏Taq酶；PCR产物放4℃冰箱。
3.2.2.2  实验结果讨论
除草剂筛选机理是转基因拟南芥中含有抗除草剂(bar)的基因，而抗除草剂的基因是PEPi载体T-DNA区域的一部分，即PEPc基因表达框与bar基因表达框是紧密连锁在一起的，经除草剂筛选能存活的苗，应该也同时含有目的基因表达框。农杆菌介导的拟南芥花粉管浸泡法的转基因插入一般都单拷贝的形式整合到植物基因组中，利用除草剂筛选，可以很方便的考察带目的PEPc基因表达框的T-DNA整合的拷贝数。

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